I. Proyecto de investigación
Problema y motivación del proyecto de investigación
Objetivos del proyecto de investigación
Alcance y limitaciones del proyecto de investigación
Modelo adaptativo multivariable de SH propuesto
Metodología del proyecto de investigación
Contribuciones del proyecto de investigación
Financiamiento del proyecto de investigación
Organización del libro de investigación
II. Fundamentos teóricos
Radio cognitiva
- Características de la radio cognitiva
- Gestión de espectro en radio cognitiva
- Arquitectura de la radio cognitiva
- Aplicaciones de la radio cognitiva
- Desafíos y futuras investigaciones en radio cognitiva
Movilidad espectral
- Handoff espectral
- Causas de un handoff espectral
- Requerimientos de un SH
- Fases de un handoff espectral
- Procedimiento de un SH
- Impacto de la movilidad espectral
- Clasificación del SH
- Tipos de enfoque del handoff espectral
- Criterios de SH
- Desafíos y futuras investigaciones en movilidad espectral
Técnicas y algoritmos para la SA
- Algoritmo Random Allocation (RA)
- Algoritmos MCDM
- Algoritmos inteligentes
- Técnicas de aprendizaje
- Funciones de decisión
- Algoritmos estadísticos
- Análisis comparativo de las técnicas y algoritmos de handoff
- Desafíos de investigación en la SA
Series de tiempo
- Notación de las series de tiempo
- Estacionariedad
- Aplicación de las series de tiempo
- Marco estadístico de las series de tiempo
- Objetivos de las series de tiempo
- Componentes de una serie de tiempo
- Modelos de series de tiempo Arima
- Funciones FAC y FACP
Trabajos relacionados
- Algoritmos para la selección de la SO
- Algoritmos para SH predictivos
Herramientas de simulación
III. Metodología
Selección del software y de los equipos
Metodología de evaluación
Tipo de red
Captura y procesamiento de los datos de ocupación espectral
Nivel de tráfico
Criterios de decisión
Clases de aplicación
Selección de los algoritmos de SH
Diseño y desarrollo de algoritmos propuestos
- Algoritmo multivariable difuso (FAHP)
- Algoritmo multivariable difuso realimentado (FFAHP)
- Algoritmo multivariable proactivo predictivo (PPTS)
Modelo adaptativo multivariable de SH (MAPFF)
- Diseño del algoritmo decisor
- Propuesta inicial del modelo adaptativo multivariable (MAPFF)
Métricas de evaluación
Desarrollo del simulador de SH
- Diseño de la herramienta de simulación
- Bases de datos
- Función Input_Data
- Función Criteria_Values
- Función ranking
- Core del algoritmo
- Funciones Data_Export y Figure
Simulador de SH proactivo-predictivo
IV. Resultados
Análisis del espectro para el enlace ascendente GSM
Herramienta de simulación de SH desarrollada
Resultados del algoritmo RA
Resultados de los algoritmos híbridos FAHP y FFAHP
- Handoff total promedio acumulativo
- Handoff fallido promedio acumulativo
- Ancho de banda promedio
- Retardo promedio acumulativo
- Throughput promedio acumulativo
- Evaluación comparativa
Resultados del algoritmo proactivo predictivo PPTS
- Handoff total promedio acumulativo
- Handoff fallido promedio acumulativo
- Handoff sin interferencia promedio acumulativo
- Handoff con interferencia promedio acumulativo
- Handoff perfecto promedio acumulativo
- Handoff anticipado promedio acumulativo
- Evaluación comparativa
Modelo adaptativo multivariable de SH MAPFF definitivo
Discusión
Conclusiones
- Conclusiones
- Contribuciones de la investigación
- Investigación futura
Referencias bibliográficas
AnexosIntroducción
Next Generation Sequencing
RNA-sequencing
Entorno y flujo de trabajo RNA-Seq
Capítulo 1. Sistema operativo
Descarga del sistema operativo
Instalación del sistema operativo
Requisitos para el sistema operativo
Paquetes generales
Bibliotecas
Capítulo 2. Herramientas bioinformáticas
Control de calidad
FastQC
Preprocesamiento
FASTX-Toolkit
RiboPicker
SAMtools
Alineamiento o mapeo
BOWTIE
BOWTIE 2
BWA
TopHat
Ensambladores
Ensambladores de novo
Ensambladores ab initio
Anotación
Augustus
BLAST
HMMER
InterProScan MAFA
RNAmmer
SignalP
TMHMM
Trinotate
Expresión diferencial
R
EdgeR
RSEM
Utilidades
Emboss transeq
TBL2ASN
Capítulo 3. Ejecución de la línea de conducción sobre datos de prueba
Análisis de calidad
Mapeo
Ordenamiento de los alineamientos
Convertir formato SAM a formato BAM
Ordenar los alineamientos
Indexación de los lineamientos ordenados
Ensamblaje
Anotación
Expresión diferencial
Capítulo 4. Formatos de archivo
Binary Alignment/map Index (BAI)
Estructura
Extensión
BAM
Estructura
Extensión
BED
Estructura
Extensión
FASTA
Estructura
Extensión
FASTQ
Estructura
Extensión
GFF
Estructura
Extensión
HMM
Estructura
Extensión
SAM
Estructura
Extensión
TSV
Estructura
Extensión
XML
Estructura
Extensión
Referencias
